虽然人类在控制乙型肝炎病*方面已经取得长足进步，但目前为止仍然没有可以彻底清除乙型肝炎病*的药物问世。所有的治疗药物，似乎都存在一定的“缺陷”，总是差那么一点点。
为什么乙型肝炎病*如此难彻底清除，主要和以下因素有关。
1.乙型肝炎病*生命力顽强
乙型肝炎病*的生命力太顽强了，想要对付它，难度很大。
实验研究证明，乙型肝炎病*在外界环境中具有很强的抵抗力，通常在37℃能稳定60分钟；一般的化学消*剂或加热到60℃持续4小时均不能将其灭活；只有煮沸10分钟或高压蒸汽℃消*10分钟，或加热65℃持续10小时，才有可能将其杀灭。
20℃储存20年以上，仍具有抗原性及传染性。乙型肝炎表面抗原在pH2.4的条件下，能保持6小时的稳定性，但病*的感染性消失。将乙型肝炎表面抗原阳性患者的血清涂抹于塑料贴面、铅片、布片或纸片上，在25℃的条件下可维持1周，6℃条件下可维持40天。
2.人体缺乏自发性病*清除机制
人的免疫力是健康的重要道防线，人体对许多病原微生物都具有自发性清除机制，可以通过免疫系统的强大功能将病*清除，然而，对乙型肝炎病*，却缺乏自发性清除机制，乙型肝炎病*可以通过免疫耐受来影响宿主的免疫应答，使人体与病*长期“和平共处”。
尤其是婴儿感染后极容易产生免疫耐受性，这也是婴幼儿感染乙型肝炎病*后，更难治愈，容易转为慢性化的原因所在。
3.乙型肝炎病*只能抑制，难以杀灭
乙型肝炎病*复制的原始模板为共价闭合环状DNA（乙型肝炎病*-cccDNA），目前用于抗病*的各种药物，如干扰素、核苷（酸）类似物，只能在乙型肝炎病*-cccDNA以下的复制环节起作用，并不能直接作用于乙型肝炎病*-cccDNA，表面上看乙型肝炎病*已经清除，但乙型肝炎病*-cccDNA仍然留在肝细胞核内，一旦条件允许，病*就可以此为模板，重新大量复制。
所以，要彻底控制、消除乙型肝炎病*的关键在于彻底清除肝细胞内的乙型肝炎病*-cccDNA。这是今后在研制新的抗乙型肝炎病*药物时的努力方向。
其次，乙型肝炎病*基因与正常肝细胞基因敌我难分。慢性乙型肝炎患者乙型肝炎病*基因已经与患者肝细胞中的基因发生了整合。病*基因与肝细胞基因整合的结果是敌我难分，使现有的各种抗病*药物对这种整合型的乙型肝炎病*失去清除能力。